多肽固相合成技術(shù)的發(fā)明同時(shí)促進(jìn)了多肽合成的自動(dòng)化。第一臺真正意義上的多肽合成儀出現在1980年代初期，它是利用氮氣鼓泡來(lái)對反應物進(jìn)行攪拌，用計算機程序控制來(lái)實(shí)現有限度的自動(dòng)合成。雖然在各項功能方面有著(zhù)明顯的缺陷，但是它畢竟把人從實(shí)驗室里解放出來(lái)，極大地提高了工作效率。
隨著(zhù)多肽科學(xué)的發(fā)展，科學(xué)家也對合成儀提出了更高的要求，從而帶動(dòng)了合成儀的發(fā)展。
第一代多肽合成儀標志性特點(diǎn)是采用氮氣鼓泡的攪拌原理來(lái)對反應物進(jìn)行攪拌，即合成儀上反應器是固定的，氮氣從反應器的下方通過(guò)反應器到上部排出，在這一過(guò)程中產(chǎn)生的汽泡把固相和液相混合起來(lái)。這樣設計的好處是結構簡(jiǎn)單，成本低，但各項功能方面有著(zhù)明顯的缺陷，目前采用氮氣鼓泡方式的第一代多肽合成儀已大部分退出了市場(chǎng)。
第二代多肽合成儀標志性特點(diǎn)是用不*性的機械攪拌來(lái)取代氮氣鼓泡，一般可分為接觸式攪拌與非接觸式攪拌兩種。接觸式攪拌常見(jiàn)的攪拌方式是伸入反應器內部的螺旋槳由上部的電機帶動(dòng)進(jìn)行快速旋轉，使反應器內部的固液兩相進(jìn)行混合。但攪拌方式帶來(lái)的不利因素如清洗障礙，合成量低，反應死角等也不容忽視，目前大多數多肽合成儀生產(chǎn)廠(chǎng)商放棄了接觸式攪拌方法。
機械性非接觸式攪拌的主要原理是反應器在直立下圍繞原點(diǎn)作左右擺動(dòng)，或者圓周運動(dòng)。這種由反應器本身的運動(dòng)而帶動(dòng)里面固液兩相混合的方法克服了接觸式攪拌帶來(lái)的缺點(diǎn)，合成產(chǎn)量和純度也明顯好于用氮氣鼓泡的第一代合成儀。所以機械性非接觸式攪拌成為了多肽合成儀的主流。但是由于這種攪拌方法不能真正消除反應死角，所以科學(xué)家們并沒(méi)有滿(mǎn)足而停下他們追求的腳步。
第三代多肽合成儀其反應器轉動(dòng)方式有別于前兩代的多肽合成儀，即反應器上方相對固定，而下方作圓周360度快速旋轉，帶動(dòng)反應器里的固液兩相從底部向上作螺旋運動(dòng)，一直達到反應器的上方，真正做到了*。*多肽合成儀的另一種方式是反應器在數控馬達的帶動(dòng)下作上下180度的翻轉運動(dòng)。固相和液相在運動(dòng)過(guò)程中不斷從反應器的一端到達另一端再返回來(lái)。一般用這種儀器合成出來(lái)的肽純度是高的，且適合于擴大生產(chǎn)。
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